O câncer colorretal (CRC) é o terceiro tipo de câncer mais comum e a segunda principal causa de morte relacionada ao câncer em todo o mundo. Pesquisa que buscou caracterizar o CRC de início precoce (<50 anos) em populações hispânicas/latinas mostrou características genômicas e transcriptômicas únicas no conjunto de dados avaliado, destacando a importância da análise multiômica para a oncologia de precisão.
Embora as taxas de CRC tenham se estabilizado ou diminuído em países ricos, os casos estão aumentando entre indivíduos mais jovens, particularmente em populações hispânicas/latinas (H/L), que apresentam o maior aumento de CRC de início precoce (<50 anos) nos EUA. Apesar disso, as populações H/L permanecem sub-representadas em estudos de perfil molecular. Aspectos-chave da caracterização molecular do CRC, cruciais para a tumorigênese, incluem o proto-oncogene MYC e a via de sinalização WNT.
Neste estudo, Carranza et al. realizaram análise multiômica de 67 amostras de CRC, sendo 30 de início precoce (EOCRC) e 37 de início tardio (LO) — de pacientes hispânicos/latinos (H/L) como parte da Cancer Moonshot Initiative's Participant Engagement and Cancer Genome Sequencing (PE-CGS) Network (Rede de Engajamento de Participantes e Sequenciamento do Genoma do Câncer da Iniciativa Cancer Moonshot).
A caracterização molecular envolveu o sequenciamento completo do exoma para identificar mutações somáticas, alterações no número de cópias somáticas (SCNAs) e similaridades genéticas globais e locais (um termo recomendado pela NASEM para ancestralidade genética). O sequenciamento de RNA foi utilizado para avaliar a expressão gênica diferencial, vias celulares e fusões gênicas. Por fim, amostras de células-tronco hematopoiéticas (EO H/L) foram comparadas com dados públicos, como o conjunto de dados GENIE do Projeto AACR, especificamente de 3.578 coortes de brancos não hispânicos (NHW), para fornecer um contexto mais amplo. Além disso, a análise incorporou três amostras de CRC com dados transcriptômicos espaciais (ST) do banco de dados 10x Genomics, usando ferramentas de bioinformática integradas com dados clínicos e genômicos (pesquisa translacional).
Os resultados apresentados na AACR 2025 e publicados na Cancer Research mostram que entre amostras de EO foi observada similaridade genética mediana de 60% com a população do Projeto 1000 Genomas Peruanos em Lima (1KG-PEL), com mutações significativas em 41 genes da via WNT, incluindo APC, TCF7L2, DKK1, DKK2, FZD10 e LRP5. Os autores descrevem que amostras com mutações em DKK1 e DKK2 apresentaram a maior proporção de genes semelhantes a 1KG-PEL (79%). Quatro genes-chave — DKK1, DKK2, FZD10 e LRP5 — foram significativos tanto nas análises de associação de risco, quanto nas análises de expressão diferencial entre as coortes H/L e NHW.
“Os tumores de EO apresentaram SCNAs e perfis de expressão gênica únicos, notadamente nos genes MYC e na via WNT alvo de fármacos, em comparação aos tumores LO. Além disso, uma nova fusão gênica de WNT, RSPO3, associada ao aumento da sinalização WNT, foi identificada em tumores de EO”, destacam Carranza e colegas, acrescentando que a análise de ST revelou padrões funcionais distintos de genes relacionados ao WNT em todos os componentes tumorais, incluindo regiões cancerígenas, imunes e estromais.
Em conclusão, este estudo caracteriza o EOCRC na população H/L, revelando características genômicas e transcriptômicas únicas que informam a oncologia de precisão e destacam a importância da análise multiômica.
Referência:
Abstract 3742: Multi-omics analysis of MYC gene and WNT signaling pathway alterations in early-onset colorectal cancer in Hispanic/Latino patients, enhanced with spatial transcriptomics approaches - Francisco Gutierrez Carranza, Brigette Waldrup, Yuxin Jin, Yonatan Amzaleg, Mackenzie Postel, David W. Craig, John D. Carpten, Salhia Badour, Daisy Hernandez, Natalia Gutierrez, Charite N. Ricker, Julie O. Culver, Carmen E. Chavez, Mariana C. Stern, Lourdes Baezconde-Garbanati, Heinz-Josef Lenz, Enrique I. Velazquez-Villarreal. Multi-omics analysis of MYC gene and WNT signaling pathway alterations in early-onset colorectal cancer in Hispanic/Latino patients, enhanced with spatial transcriptomics approaches [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2025; Part 1 (Regular Abstracts); 2025 Apr 25-30; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2025;85(8_Suppl_1):Abstract nr 3742.
