Vinícius Marques Rocha (foto), do Instituto do Câncer do Estado de São Paulo (ICESP), é primeiro autor de estudo selecionado em poster no AACR 2025. O trabalho buscou calibrar um escore de risco poligênico para câncer de próstata (CaP) em uma coorte brasileira. Os resultados preliminares, a partir de dados de 557 pacientes, sugerem que a prevalência de variantes patogênicas em genes de alto/moderado risco em pacientes com CaP é semelhante à de outras populações em todo o mundo.
Existem dados limitados sobre a herdabilidade de CaP no Brasil, um país com composição étnica miscigenada. Neste estudo caso-controle, foram inscritos pacientes com CaP não selecionados, que tiveram amostras de CaP analisadas por sequenciamento do genoma completo (SGC). As proporções de ancestralidade também foram estimadas.
“Primeiro realizamos downsampling aleatório in silico dos dados de SGC, inicialmente com profundidade de 30x para 15x, utilizando amostras de 3 brasileiros, para estimar as porcentagens de similaridade de variantes e variantes raras perdidas em decorrência da menor cobertura”, descrevem os autores. Foram consideradas apenas variantes raras de alta qualidade (≤ 1% em bancos de dados populacionais), provavelmente funcionais (regiões exônicas ou de splicing), excluídos os cromossomos X, Y e o DNA mitocondrial.
O sequenciamento em profundidade de 15x identificou 94,2% a 97,1% das variantes heterozigotas detectadas em profundidade de 30x, com perda média esperada de variantes de 4,3%.
Posteriormente, o SGC com profundidade de 15x foi realizado em amostras 557 pacientes com CaP, com mediana de 64,6 anos (41-90 anos) ao diagnóstico. A cor da pele foi autorrelatada como branca (44,8%), parda (37,4%) e negra (13,2%), refletindo a heterogeneidade da coorte avaliada. Os pesquisadores relatam que a maioria dos pacientes foi diagnosticada com estádios clínicos II (32,8%) e III (43,1%) e graus ISUP 2 (40,2%) e 3 (22,9%). Houve mistura ancestral significativa, com composição genética predominantemente EUR (61,4%), seguida por AFR (24,6%), INDIG (7,7%), asiática (1,6%) e Oriente Médio (4,7%).
Os resultados de Rocha et al. mostram que variantes patogênicas em genes de alto/moderado risco para CaP foram identificados em 29 de 557 pacientes (5,2%), incluindo BRCA2 (n=8), CHEK2 (n=5), ATM, BRCA1, BRIP1, MLH1, PALB2, PMS2 (n=2 cada) e MSH2, MSH6, NBN, RAD51C e TP53 (n=1 cada). Um paciente era portador de VGPs em PALB2 e TP53. As variantes incluíram 9 mutações de frameshift, 4 mutações de sítio de splicing e 17 mutações missense. Todas essas variantes serão confirmadas em avaliações subsequentes.
“Em uma população predominantemente miscigenada, a análise de SGC com profundidade de 15x parece apropriada para o rastreamento de variantes de alto risco. Embora haja pequena chance (aproximadamente 5%) de não serem encontradas VGP raras ou de serem detectados falsos-positivos, do ponto de vista populacional, a subamostragem parece ser aceitável, comparando os benefícios do sequenciamento com 15 vezes o número de amostras versus 30 vezes”, concluem os autores.
Além de Vinícius Marques Rocha, o trabalho tem a participação de Vitória Pelegrino do Val, Maria Lucia H. Katayama, Taís Vaz, Simone Maistro, Isabela Archanjo Nunez, Luciane Sussuchi da Silva, Fernando Marcon Passos, Jaqueline Wang, Rosimeire Aparecida Roela, Fátima Solange Pasini, Gláucia Fernanda de Lima Pereira, Rossana Verônica Mendonza Lopez, José Pontes Júnior, Fabio Pescarmona Gallucci, Juliana Macedo dos Santos, Letícia Montanha de Assis, Elisa Mei Utsunomiya, Beatriz Fernandes de Souza, Rafael Lara Nohmi, Gabriel Ficagna Zaccaron, Luiz Antonio Senna Leite, Maria del Pilar Estevez-Diz, Cristovam Scapulatempo Neto, Roger Chammas, William Carlos Nahas, Guilherme Lopes Yamamoto e Maria Aparecida Azevedo Koike Folgueira, todos do ICESP.
A pesquisa é apoiada pelo CNPQ.
Referência:
Abstract 1007: Rastreamento de variantes germinativas patogênicas em genes de predisposição ao câncer de próstata em uma coorte etnicamente diversa de pacientes com câncer de próstata não selecionado - Vinícius Marques Rocha, Vitoria Pelegrino do Val, Maria Lucia Hirata Katayama, Tais Vaz, Simone Maistro, Isabela Arcanjo Nunez Arcanjo Nunez, Luciane Sussuchi da Silva, Fernando Marcon Passos, Jaqueline Wang, Rosimeire Aparecida Roela, Fátima Solange Pasini, Gláucia Fernanda de Lima Pereira, Rossana Veronica Mendonza Lopez, José Pontes Júnior, Fabio Pescarmona Gallucci, Juliana Macedo dos Santos, Leticia Montanha de Assis, Elisa Mei Utsunomiya, Beatriz Fernandes de Souza, Rafael Lara Nohmi, Gabriel Ficagna Zaccaron, Luiz Antonio Senna Leite, Maria del Pilar Estevez-Diz, Cristovam Scapulatempo Neto, Roger Chammas, William Carlos Nahas, Guilherme Lopes Yamamoto, Maria Aparecida Azevedo Koike Folgueira. Screening pathogenic germline variants in prostate cancer predisposition genes in an ethnically diverse cohort of unselected prostate cancer patients [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2025; Part 1 (Regular Abstracts); 2025 Apr 25-30; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2025;85(8_Suppl_1):Abstract nr 1007.
